Secara legal Organ Yayasan Masjid Al Falah Surabaya terdiri dari: Pembina, Pengawas dan Pengurus. Dan ditambah dengan kekhasan Al Falah, yaitu Dewan Syariah.
Ketua : Irwitono, ST, MM
Anggota :
Ketua : Ir. Dwi Andi Handaya Rusman, M.Sc.
Sekretaris Umum : Ir. Subchan Bashori, M.M.
Sekretaris : Suprijanto
Bendahara Umum : Aun bin Abdullah Baroh
Bendahara : Kankan Iskandar, SE, MM
Ketua : Drs. Jazid Nawawi, Ak
Anggota :
Ketua : Ahmad Mudzofar Jufri, Lc, MA
Anggota :
Ketua Takmir : Salahuddin Hanafi, SE.
Wakil Ketua I : Saukat Ali Zainuddin, S.H.
Wakil Ketua II : H. Jupri
Direktur LPF : Ustadz Jusa Idrawan, M.Pd
Wakil Direktur I Sub Direktorat Perencanaan Strategis dan Humas Marketing : Ustadzah Tutik Susilowati, S.S., M.pd.
Wakil Direktur II Sub Direktorat Operation : Ustadz Marjoko
Direktur : Ustadz Mukhtar Ismail, S.Ag
Kabid Kurikulum & SDM : Ustadz Nurul Huda, M.Pd.I
Kabid Amal Usaha & Sarpras : Ustadz Mohammad Hanafi, S.HI
Kabid Adm & Keuangan : Ustadzah Esti Wahyu Dewanti, S.Pd
Manager : Fury Rachmawati
Biro Muhtadin Al Falah
Biro Konsultasi Al Falah
Remaja Masjid Al Falah
KB-TK Al Falah Surabaya
SD Al Falah Darmo Surabaya
Kepala Sekolah Yuni Wakhidah, S.Pd.
Waka Sarana & Prasarana : Siti Maryam
Waka Kesiswaan : Sufiatin Ekasari
Waka Kurikulum : Yuliah Dyah Sriwilujeng
SMP Al Falah Darmo Surabaya
Kepala Sekolah : Darmanto, S.Pd., M.Pd.
Wakil Kepala Sekolah
SMP Al Falah Deltasari Sidoarjo
Kepala Sekolah : Gatot Purwanto, S.Sos
Waka Sarpras & SDM : Al Musta’anu, M.Pd.I
Waka Kurikulum : Annura Wulan Darini, S.Hum.,M.Pd